Digital Image Analysis in Pathology (DIAPATH)

Centres de Recherche Transdisciplinaire | Liste des Centres

(Code: ULB723)

DIAPATH est une unité de recherche transdisciplinaire et interfacultaire (Facultés de Médecine et École polytechnique de Bruxelles) intégrée au
''Center for Microscopy and Molecular Imaging'' (CMMI, Biopark de Gosselies). DIAPATH développe une approche intégrée pour la caractérisation, la validation
et le monitoring de biomarqueurs protéiques au sein de tissus animaux et humains (en collaboration étroite avec le laboratoire d'Anatomie pathologique
de l'hôpital Erasme). Cette approche fait appel aux techniques histologiques et immunohistochimiques, à l'analyse d'image, aux biostatistiques et au
''data mining''. L'immunohistochimie (IHC) a l'avantage de préserver l'aspect morphologique du tissu analysé et permet ainsi la localisation de l'antigène
ciblé au niveau histologique et cellulaire. Par le traitement simultané de milliers d'échantillons, la technologie du ''tissue microarray'' (TMA) apporte
une standardisation accrue de l'IHC pour le screening de l'expression de protéines et offre un outil de choix pour la validation de biomarqueurs dans le
cadre d'études précliniques et cliniques. La technique de ''cell-block'' permet d'appliquer la même méthodologie à la caractérisation de cultures
cellulaires. DIAPATH dispose notamment d'un scanner de lames qui permet la réalisation de lame virtuelle ainsi qu'une caractérisation objective et
quantitative des immunomarquages par analyse d'images. Des techniques spécifiques de traitement et d'analyse des très grandes images (> 4 Giga pixels) produites
par le scanner sont développées afin de rendre compte de l'hétérogénéité des marquages IHC par l'extraction de descripteurs originaux (en colaboration
avec le LISA, Laboratoire d'Image: Synthèse et Analyse, de l'EPB). Ces techniques visent aussi à caractériser la colocalisation de marquages realisés
sur coupes sériées. Des bases de données sont ensuite constituées sur de grandes séries d'échantillons, intégrant les données biologiques et les
données anatomocliniques et/ou pharmaceutiques, suivant le contexte de chaque étude. Ces données sont ensuite soumises à des méthodes modernes d'analyse
de données multivariées. L'objectif général est d'extraire, d'une part, des informations utiles à la compréhension de processus pathologiques et de
réponses thérapeutiques, et, d'autre part, d'identifier et de valider de nouveaux biomarqueurs utiles à la démarche diagnostique, pronostique et
thérapeutique.

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Domaines Frascati :

 • 1.2 Informatique et science de l’information

 • 2.6 Ingénierie médicale

 • 3.2 Médecine clinique

 • 3.4 Biotechnologie médicale

Disciplines CRef :

 • Anatomopathologie

 • Cancérologie

 • Histologie

 • Histopathologie

 • Imagerie médicale, radiologie, tomographie

 • Ingénierie biomédicale

 • Intelligence artificielle

 • Sciences biomédicales

 • Sciences de l'ingénieur

 • Techniques d'imagerie et traitement d'images

Domaines de l'unité :

 • Biologie moléculaire et biotechnologies

 • Informatique et technologies de l'information et de la communication