La recherche à l'ULB ⤶ |
Description de l'Unité | Projets de l'Unité | Composition |
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(Code: ULB723)
Responsables de l'unité : SALMON Isabelle, DECAESTECKER Christine. |
DIAPath est une unité de recherche transdisciplinaire et interfacultaire (Facultés de Médecine et École polytechnique de Bruxelles) intégrée au ''Center for Microscopy and Molecular Imaging'' (CMMI, Biopark de Gosselies). DIAPath développe une approche intégrée pour la caractérisation, la validation et le monitoring de biomarqueurs histopathologiques au sein de tissus animaux et humains (en collaboration étroite avec le laboratoire d'Anatomie pathologique de l'hôpital Erasme). Cette approche fait appel aux techniques histologiques, d' immunohistochimie (IHC) et d'hybridation in situ (CISH), à l'analyse d'image (impliquant l'Intelligence Artificielle), aux biostatistiques et au data mining. L'IHC et la CISH ont l'avantage de préserver l'aspect morphologique du tissu analysé et permettent ainsi la localisation de la cible au niveau histologique et cellulaire. Par le traitement simultané de milliers d'échantillons, la technologie du ''tissue microarray'' (TMA) apporte une standardisation accrue de l'IHC pour le screening de l'expression de protéines et offre un outil de choix pour la validation de biomarqueurs dans le cadre d'études précliniques et cliniques. La technique de ''cell-block'' permet d'appliquer la même méthodologie à la caractérisation de cultures cellulaires. DIAPath dispose notamment d'un scanner de lames pour la réalisation de lames virtuelles ainsi que la caractérisation objective et quantitative des marquages par analyse d'images. Des techniques spécifiques de traitement et d'analyse des très grandes images (> 4 Giga pixels) produites par le scanner sont développées afin de rendre compte de l'hétérogénéité des marquages IHC par l'extraction de descripteurs originaux (en colaboration avec le LISA, Laboratoire d'Image: Synthèse et Analyse, de l'EPB). Ces techniques visent aussi à caractériser la colocalisation de marquages realisés sur coupes sériées. Des bases de données sont ensuite constituées sur de grandes séries d'échantillons, intégrant les données biologiques et les données anatomocliniques et/ou pharmaceutiques, suivant le contexte de chaque étude. Ces données sont ensuite soumises à des méthodes modernes d'analyse de données multivariées. L'objectif général est d'extraire, d'une part, des informations utiles à la compréhension de processus pathologiques et de réponses thérapeutiques, et, d'autre part, d'identifier et de valider de nouveaux biomarqueurs utiles à la démarche diagnostique, pronostique et thérapeutique.
Localisation : | CMMI - Center for Microscopy and Molecular Imaging |
Adresse : | CP305/1 - Rue Adrienne Bolland, 8 - B-6041 Charleroi (Gosselies) |
Téléphone : | +32-2-650.9354/9789 |
Fax : | +32-2-650.9795 |
Email : | diapath@cmmi.be |
Site Web : | https://www.cmmi.be/?page_id=12 |
• 1.2 Informatique et science de l’information
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